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Kann ich das Apache Modul mod_env nutzen?

Ja, dies ist in jedem Managed Hosting Tarif und auf eigenen Managed FlexServern möglich.

In einer ".htaccess" Datei können Sie einfach die gewünschten Anweisungen einfügen, z.B.:

SetEnv GO_BASE_PATH /home/ftpuser/www.domain-bei-profihost.de/dev/

Wichtig für PHP

Die Variable wird in PHP wie folgt gesetzt:

_SERVER["REDIRECT_GO_BASE_PATH"]    = "/home/ftpuser/www.domain-bei-profihost.de/dev/"

PHP versieht hier aus Sicherheitsgründen die Variable mit dem Präfix "REDIRECT_", damit eventuell vorhandene Umgebungsvariablen nicht versehentlich überschrieben werden.
In Ihren Skripten können Sie die Variable danach prüfen und verwenden (hier in PHP):

if( isset($_SERVER['GO_BASE_PATH']) or isset($_SERVER[REDIRECT_GO_BASE_PATH']) )
{

}